Родился в Актау в 1967 году. Здесь же окончил среднюю школу. В 1984 году стал учеником токаря ремонтно-механической мастерской Рудоуправления ПГМК. В 1985 году поступил в Воронежское высшее военно-авиационное инженерное училище. По окончании которого получил диплом инженера-метеоролога. Впоследствии получил второе высшее образование в Центрально-Азиатском университете Алматы, по специальности «Маркетинг и коммерция», квалификация – «Экономист-маркетолог».
С 1990 по 1992 год служил в рядах Вооруженных сил.
Дальнейшая трудовая деятельность Сергея Ворожейкина связана с судоходством и морскими грузоперевозками.
С 1992 по 1997 год трудился в Актауском филиале фирмы «Казахстан-Сервис»: ведущим специалистом, ведущим менеджером отдела Внешних экономических связей, заместителем директора по экономике.
С 1997 по 2000 год работал руководителем группы по маркетингу и коммерции, менеджером по маркетингу и коммерции, начальником отдела коммерции и грузовой работы Международного морского торгового порта Актау.
С 2000 по 2001 год работал в Актауском филиале ЗАО «Ак Бидай» – сначала менеджером по коммерческим вопросам, после возглавил филиал.
С 2001 по 2005 год трудился в ЗАО «Национальная морская судоходная компания «Казмортрансфлот»» главным менеджером представительства НМСК в Актау, директором коммерческого департамента, советником генерального директора «Казмортрансфлота».
В 2005 году стал заместителем генерального директора по коммерческим вопросам и корпоративному развитию АО «Казмортрансфлот», далее управляющим директором по коммерческим вопросам.
С 2008 по 2017 год – генеральный директор ТОО «OMS Shipping».
С сентября 2017 года по май 2018 года – генеральный директор ТОО «OMS Agency». Неоднократно повышал свою квалификацию в крупных ВУЗах России и Европы. Труд Сергея Ворожейкина отмечен многочисленными правительственными наградами.
Женат, воспитывает двух сыновей.